مراکز تحقیقاتی همانند پژوهشکده هیدرودینامیک کاربردی و سامانه های دریایی که مرکزی برای یادگیری و تحقیق هستند بایستی پیشرفت نوآوری و انتقال فناوری را نیز تسریع کنند. به همین جهت با ارائه امکانات فنی، برنامه های کارآفرینی، شتابدهی و حتی صندوق‌های سرمایه‌گذاری در کمک به توسعه ایده‌های جدید شرکت می کنند ولی نباید نقش آنها در تحقیقات فن ژرف که باعث نوآوری در بلند مدت می شود به خطر بیافتد. لذا نیاز به تسهیل کننده‌هایی همچون مرکز نوآوری و توسعه فن ژرف هیدروتک  می باشد تا بر روی ارتباطات، منتورینگ و تامین امکانات تمرکز کنند. به همین جهت پژوهشکده هیدرودینامیک کاربردی و سامانه های دریایی برای فعال نمودن ظرفیت ها و توانایی های دانش بنیان و رفع نیاز های صنعتی در قالب تجاری سازی دانش فنی و ایجاد شرکت‌های دانش‌بنیان، مرکز نوآوری و توسعه فن ژرف هیدروتک را با حضور دکتر ستاری معاون علمی و فناوری ریاست جمهوری در مهر ماه ۱۳۹9 افتتاح نمود.